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フィルジェン / フィルジェン ID: J00610

TaqMan® SNP Genotyping Assays 受託解析 ID: J00610

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高い再現性のSNPタイピングが可能

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サービスについて

概要

アッセイ総数約450万を誇るTaqMan® SNP Genotyping Assaysは、高い信頼性と多くの実績を持つ、中～小規模のSNPタイピング実験に理想的な試薬です。高い再現性のSNPタイピングを可能としています。プライマーとそれぞれのアリルに対応した2種類のTaqMan® プローブを利用して、リアルタイムPCRシステムで解析します。また、目的のアッセイは、遺伝子名やキーワード、ゲノム領域など、様々な情報から簡単に検索できます。

特長

  • 大規模疾患関連解析の2次スクリーニング、疾患関連候補遺伝子検索、遺伝子絞込みのファインマッピング研究などに最適
  • SNP領域を検出するPCRプライマーとアレルを識別するTaqMan® プローブが1本のチューブで提供されており、条件検討やアッセイ構築の必要がなく、確実に良質なデータをご提供できます。
  • 優れたデザイパイプラインにより、信頼性、再現性の高い結果をご提供いたします。
  • ヒト、マウスそれぞれに特化された、専用のSNP検索フリーウェアが、サーモフィッシャーサイエンティフィック（ABI）より、提供されており、TagSNPやハプロタイプを確認しながら、最も有効なSNPの検索を可能としています。

サービス内容

  • リアルタイムPCRを用いたSNPタイピングの原理（fig.1）

    既報のSNPを確認するSNPタイピングでは、TaqMan® プローブとリアルタイムPCRシステムを利用することで、簡便で短時間に行えるというメリットがあり、またすでに多くの研究で利用されているという実績もあります。以下に、そのSNPタイピングの原理について説明します。
    まず、ゲノム上でSNPを含む領域を増幅できるPCRプライマーを1セットとゲノムDNAの一塩基変異に対応するTaqMan® プローブを2種類用意します。それぞれのTaqMan® プローブは、Allele1とAllele2に相補的な配列を有しています。これらのプライマーとTaqMan® プローブ、ゲノムDNAを混合し、PCRを行うことで、2種類のAlleleのSNPが検出できます。（fig.1-1,3）
    リアルタイムPCRによる遺伝子発現定量では目的の遺伝子領域を増幅して発現量を比較しますが、SNPタイピングではゲノム上の各AlleleをTaqMan® プローブで識別してSNPを検出する事になるので、「A/Aのホモ」の場合はAというSNPを検出するTaqMan® プローブの蛍光のみが検出され、「A/Gのヘテロ」の場合はAとGの両方のSNPを検出する2種類のTaqMan® プローブの蛍光が検出されることになります。（fig.1-3）

    • fig.1 リアルタイムPCRを用いたSNPタイピングの原理
  • アッセイの種類

    ・国際HapMapプロジェクトからの350万アッセイを含む、総数450万アッセイを誇る世界最大のコレクション
    ・タンパク質の変異に関わるcSNP用タイピング試薬：7万種類
    ・発現頻度解析済みのマーカー用SNPタイピング試薬：16万種類
    ・疾患関連遺伝子検索に最適なデザイン済みSNPタイピング試薬：450万種類
    ・マウス用デザイン済みアッセイ：1万種類以上
  • 簡単な検索と、ハプロタイプブロック情報の提供

    TaqMan® SNP Genotyping Assaysは、SNPbrowserTM ソフトウェアを利用するハプロタイプ毎の検索や、Webからのキーワード・遺伝子領域からの検索・選択ができます。
    SNPbrowserTM ソフトウェアでは、ゲノム上のハプロタイプブロックを公開しているので、連鎖不均衡を利用する疾患関連遺伝子の探索などで有効にお使い頂けます。また、ハプロタイプブロック内でタグとなるSNPの検索ができるので、効果的な解析が可能です。
  • SNPタイピング用カスタム試薬

    TaqMan® SNP Genotyping Assays以外のSNPタイピングアッセイをご希望の場合は、カスタム試薬をご用意いたします。Custom TaqMan® SNP Genotyping Assaysは、様々な生物種のゲノムやSNPにも対応可能なカスタムメイドのSNPタイピング試薬です。目的のSNPを含むゲノムDNA配列から最適なSNPタイピング試薬をカスタムメイドで検索・合成します。ヒトSNPの場合、ヒトゲノムDNAを用いて、タイピング試薬が機能することを確認後applied biosystems社より出荷されます。
  • マウス用デザイン済みアッセイ

    TaqMan® デザイン済みSNPジェノタイピングアッセイに、新たにnon-humanのラインナップが加わりました。この第一弾として、マウス用のpre design（Made to Order）Assay が発売開始となりました。専用の検索用フリーウェアー”Mouse SNP BrowserTM ”も提供されており、1万以上のラインナップから実験目的に合わせて最も効果的なSNPをご選択頂けます。

ご注文に関して

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参考価格・納期

サービス内容 価格（税抜）
N＝1 N＝2 N＝3
基本料金/1SNP・250反応
・TaqMan® SNP Genotyping Assays
　（Pre-Designed/Made to Order）		 ￥118,000
Cat.#F-QPCR-SNP
基本料金/1SNP・125反応
・TaqMan® SNP Genotyping Assays
（TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays使用）		 ￥133,000
Cat.#F-QPCR-DME
基本料金/1SNP・250反応
・TaqMan® SNP Genotyping Assays
　（custom）		 ￥195,000
Cat.#F-QPCR-SNP-CTJ
・Custom TaqMan Assay Design Tool（Thermo Fisher Scientific）を使用して設計いたします。
・合成に4～5週間程度かかります。
・設計配列を合成前にお客様へご確認することなく合成させて頂きます。
（合成完了後には確認できます。）
SNPタイピング反応/1サンプル ￥2,100
Cat.#F-QPCR-N1		 ￥4,200
Cat.#F-QPCR-N2		 ￥6,300
Cat.#F-QPCR-N3
ゲノムDNA抽出作業/1サンプル 「DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。
サンプル濃度調整・測定 ￥1,000×サンプル数

＊ ゲノムDNAをお送り頂く場合は、濃度調整した状態（濃度をそろえて、濃度測定値を記載してください。）でお送り下さい。
　 フィルジェンで濃度調整や濃度測定が必要な場合は、上記の「サンプル濃度調整・測定」の費用が別途必要となります。
　 濃度を1～10ng/μLの範囲で、全てのサンプルについて、統一して調整して頂ければ、「サンプル濃度調整・測定」は、不要です。

関連サイト

  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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