概要
動植物全ゲノムシークエンシング受託解析サービスは、illumina NovoSeq6000 にて、ゲノムDNAをシークエンスいたします。シークエンス量は、1Gb単位でご指定いただくことが可能であり、有償オプションとして、バイオインフォマティクス解析も用意しています。バイオインフォマティクス解析には、リファレンスが既知のサンプルの場合は、ゲノムに対するアライメント及び変異検出を行います。ゲノム未知のサンプルでバイオインフォマティクス解析を希望される場合は、ご相談ください。
特長
- 次世代シークエンステクノロジーによるゲノムシークエンス
- シークエンス量は、1Gb単位で調整可能
- バイオインフォマティクス解析にも対応（有償オプション）
サービス内容
ご送付いただいたDNAサンプルを用いて、品質チェック（QCチェック）からシークエンスまで実施いたします。さらに、オプションでバイオインフォマティクス解析にも対応いたします。バイオインフォマティクス解析（提携先であるNovogene社が用意する解析パッケージ）もご用意しています。
【シークエンスプラットフォーム】
illumina NovaSeq6000, PE150
【シークエンス量】
ご指定のデータ量（1Gb～raw deta）/sample
＊ QCチェックに合格したサンプルは、シークエンス量の保証対象となります。
＊ 保証量は、お申込みいただいたシークエンス量の98%となります。
【作業内容】
- サンプルQCチェック
- ライブラリー作製
- シークエンス作業
- バイオインフォマティクス解析（有償オプション）
＊ ライブラリーについて、PCR-freeタイプにも対応いたします（別途有償）
＊ De Novo解析の場合、サービス内容は、プロジェクト内容に依存して変更される場合があります。
【バイオインフォマティクス解析】
＜解析パッケージ＞
リファレンスゲノムが公開されているサンプルの場合、マッピング、変異検出、検出された変異へのアノテーションの各解析をまとめたパッケージをご用意しております（ゲノムリシークエンシング（
fig.1））。リファレンスが未知のサンプルの場合、ご相談ください。
変異検出は、SNP/InDelの解析と、SNP/InDel/SV/CNVの解析の2種を用意しています。
＊ パッケージに解析内容は、業務提携先のパイプラインの変更・更新等により、変更される場合があります。
デモレポートを用意しておりますので、ご希望される場合はお知らせください。
