Novogene / フィルジェン ID: J00599

ゲノムリシークエンシング 受託解析サービス ID: J00599

SNPや挿入・欠失、その他ゲノム配列の構造変化を調べるゲノムリシークエンシング解析に対応

サービスについて

概要

ゲノムリシークエンシング受託解析サービスでは、得られたリード配列を既知のゲノム配列にマッピングさせ、SNPや挿入・欠失、その他ゲノム配列の構造変化を調べるゲノムリシークエンシング解析に対応しています。

サービス内容

  • サービス仕様

    使用機種illumina HiSeq X Ten
    ライブラリー種類Paired-end reads 150bp
    保証データ量指定のデータ量(1~90Gb)で解析可能
    作業内容QCチェック、ライブラリー作製、シークエンス作業
    最低注文数1サンプル

    * 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。QC結果やライブラリー作製などの問題で、再度サンプルをお送りする場合は、別途送料をご請求させて頂きます。

  • NGS Variant 解析サービス(オプション)解析例

    使用ソフトウェア:CLC Genomics Workbench

    リファレンス配列にリード配列をマッピングし、SNPの存在する配列上の位置・変化した塩基の種類・変異領域をカバーするリード数、アミノ酸置換などをまとめたリストをエクセル形式で納品します。(fig.1

必要サンプル量

  • ゲノムDNA:1μg以上(2μg以上を強く推奨)
  • 容量:20μL以上
  • 濃度:20ng/μL以上
  • O.D.260/280:1.8~2.0
  • Buffer:TE BufferまたはddH2O
  1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
    * 電気泳動は、次の条件で実施してください。 1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 50 min.
  2. RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。
  3. ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE bufferまたはddH2Oにて保存してください。
    * 長期保存の場合は、-20℃または-80℃で保存してください。
  4. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNA, dsDNA, ssDNA, フリーの核酸等も同時に検出するため、ゲノムDNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
    * UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。
  5. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。

納品データ

FastQ file(fastq.gz)

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
ゲノムリシークエンシング 受託解析サービス お問い合わせ 約2ヶ月

* 110Gb以上をご希望の場合は、別途お問合せください。

関連サイト