カテゴリー
関連サイト
お問い合わせ
詳細検索
Novogene / フィルジェン ID: J00598

ヒト全ゲノムシークエンス 受託解析サービス ID: J00598

印刷

かつてないハイスループットによる低コスト化の実現

カテゴリ

サービスについて

概要

全ゲノムシークエンシング（WGS）は一度の解析で個人の有する変異を網羅的に検出することが可能であり、がんを含む様々な疾患研究、ゲノム薬理学、集団遺伝学など幅広い分野で利用されています。フィルジェン社提携先であるNovogene社は、30の強力なillumina Novaseq X Plus及び、NovaSeq6000システムにより、年間最大280,000のヒトゲノムの解析を、より低価格で実施することを実現しています。

特長

  • 次世代シークエンステクノロジーによる全ゲノムシークエンス
  • かつてないハイスループットによる低コスト化の実現
  • バイオインフォマティクス解析にも対応（有償オプション）

サービス内容

ご送付いただいたDNAサンプルを用いて、品質チェック（QCチェック）から次世代シークエンスまで実施いたします。さらに、オプションでバイオインフォマティクス解析にも対応いたします。バイオインフォマティクス解析は、フィルジェン社提携先であるNovogene社が用意する解析パッケージ、又はフィルジェン社の提供するデータマイニングサービスからお選びいただけます。

【シークエンスプラットフォーム】（fig.1）br> illumina Novaseq X Plus/NovaSeq6000, PE150


【シークエンス量】
90Gb raw data/sample
＊ QCチェックに合格したサンプルは、シークエンス量の保証対象となります。
＊ 保証量は、お申し込みいただいたシークエンス量の98％となります。

【作業内容】
  • サンプルQCチェック
  • ライブラリー作製
  • シークエンス作業
  • バイオインフォマティクス解析（有償オプション）

【バイオインフォマティクス解析】

＜解析パッケージ＞（fig.2）
マッピング、変異検出、検出された変異へのアノテーションの各解析をまとめたパッケージをご用意しております。
同一個体由来のTumor-Normalペアサンプルの場合、50somatic mutationの検出及びアノテーションも実施いたします。
＊ パッケージの解析内容は、業務提携先のパイプラインの変更・更新等により、変更される場合があります。

fig.1 illumina NovaSeq X Plus

fig.2 ヒト全ゲノムシークエンス
＜解析データ例＞（fig.3）（fig.4）（fig.5）（fig.6）
＊ご希望される方には、デモレポートをお送りしますので、お知らせください。

fig.3 Pie charts of detected SNPs（top）and InDels（bottom）.

fig.4 Bar plots of detected SVs.

fig.5 Statistics of detected CNVs.

fig.6 Annotation Results of detected variants（a bridged）.

納品物

  • サンプルQCレポート
  • FASTQ形式のシークエンスデータ
  • バイオインフォマティクス解析データ（バイオインフォマティクス解析をお申し込み頂いた場合）
  • プロジェクトレポート
＊ USB等の記録メディアにて納品いたします。
＊ プロジェクトによって、納品物が変更される場合があります。

サンプル条件

サンプルタイプ Amount（Qubit） 液量 濃度 純度（NanoDrop）
ゲノムDNA ≧1μg ≧20μL ≧20ng/μL O.D.260/280=1.8～2.0
no degradation or RNA contamination
FFPE DNA ≧1μg - - Fragment should be longer than 1000bp
  1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
    ＊ 推奨泳動条件： 1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 40 min.
  2. RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。
  3. DNase、RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。（スクリューキャップ式を推奨します。）
  4. ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE bufferにて保存してください。
    ＊ 長期保存の場合は、-20℃または-80℃で保存してください。
  5. UVスペクトルベースの濃度測定法では、DNAの濃度が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
    ＊ UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。
  6. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。
  7. サンプルの最終的な品質は、業務提携先でのQCチェックの結果に従いますこと、予めご了承ください。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス内容 数量 価格（税抜） Cat.# 納期
ヒト全ゲノムシークエンス受託解析サービス
（90Gb raw data/sample）		 1サンプル お問合せ F-Novo-WGS90 約1.5ヶ月（バイオインフォマティクス解析付：約2～2.5ヶ月）
ヒト全ゲノムシークエンス受託解析サービス
（90Gb raw data/sample）
バイオインフォマティクス解析付		 F-Novo-WGS90D

＊ 海外へのサンプル輸送費用および納品用ハードディスク費用が別途必要です。
ご指定のデータ量がございましたら、お問合せください。
＊ 納期は、サンプルのQCチェック合格後の日数です。
＊ 年末年始、夏季休業、祝祭日、解析状況等により、上記より日数を頂く場合がございますこと予めご了承ください。

関連サイト

  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

/

お問い合わせリストへ

※お問い合わせは完了しておりません。