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ID: E00028
タカラバイオ / タカラバイオ

相乗りシーケンス解析

高速シーケンス解析をリーズナブルにご提供


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析 > 次世代シーケンス解析

サービスについて

特長

  • イルミナ社HiSeq、NovaSeqを用いたハイスループットな塩基配列解析
  • 幅広いアプリケーションに対応
  • 国内設備と安心のセキュリティ体制

概要

次世代シーケンサーのデータ産生能力は年々増加しており、アプリケーションによってはオーバースペックになっています。タカラバイオでは、イルミナ社HiSeqまたはNovaSeqを用いたペアエンドシーケンス解析を複数のお客様でシェアしていただくことにより、最適なデータ量をお求めやすい価格でご提供いたします。

サービス内容

HiSeqまたはNovaSeqのペアエンドシーケンスの解析単位である1レーン分を複数ユーザでシェアしていただくサービスです。HiSeq 2500を用いた100base長ペアエンドシーケンスまたはNovaSeq 6000を用いた150base長ペアエンドシーケンスを実施いたします。使用するライブラリーキットや得られるデータ量の目安はアプリケーションによって異なります。以下の表をご参照ください。

  • DNA-seq解析、全ゲノムシーケンス解析
    HiSeq 4 Gbase 相乗りプラン:
    微生物のゲノムドラフト解析やゲノムサイズが200Mbase程度までの生物の変異解析に最適です。PCRフリーライブラリーもご選択いただけます。

    NovaSeq 90 Gbase 相乗りプラン:
    ヒト、マウスなどの全ゲノムシーケンス、変異解析にご利用ください。

    ・シーケンス解析
    シーケンサー ライブラリー データ量(目安) 送付サンプル 価格(税別) 納期
    HiSeq 2500(100PE) TruSeq Nano DNA
    Library Prep Kit
    4 Gbase/検体 ゲノムDNA 500ng以上
    (濃度 20ng/μL以上)
    ¥140,000 約2~4週間
    ★短納期
    TruSeq DNA
    PCR-Free Library
    Prep Kit
    4 Gbase/検体 ゲノムDNA 2μg以上
    (濃度 40ng/μL以上)
    ¥145,000 4~6週間
    ★短納期
    NovaSeq 6000
    (150PE)
    TruSeq DNA
    PCR-Free Library
    Prep Kit
    90 Gbase/検体 ゲノムDNA 2μg以上
    (濃度 40ng/μL以上)
    ¥175,000 約2ヶ月
    ・情報解析【オプション】
    サービス内容 情報解析 検体数/データ量 参考価格 参考納期 備考
    ヒト全ゲノム
    シーケンス解析
    変異解析 1検体/90 Gbase ¥115,000 +約2週間 マッピング結果(bamファイル)と変異検出結果(vcfファイル)、変異のアノテーション情報を付加したエクセルファイルを納品
  • ヒトエクソーム解析
    納期重視のHiSeq相乗りプラン、多検体を低価格で解析可能なNovaSeq相乗りプランをご用意しています。NovaSeq相乗りプランは、検体数に応じた価格設定をしています。下記以外の検体数の場合はお問合せください。

    ・シーケンス解析
    シーケンサー ライブラリー データ量(目安) 送付サンプル 価格(税別) 納期
    HiSeq 2500
    (100PE)
    SureSelect
    (Human All Exon V6)
    5 Gbase/検体 ゲノムDNA 5μg以上
    (濃度 100ng/μL以上)
    ¥160,000 約2~4週間
    ★短納期
    NovaSeq 6000
    (150PE)
    SureSelect
    (Human All Exon V6)
    100 Gbase/8検体 ゲノムDNA 500ng以上
    (濃度 20ng/μL以上)
    ¥750,000/8検体
    *約¥94,000/検体
    約2ヶ月
    100 Gbase/16検体 ¥1,150,000/16検体
    *約¥72,000/検体
    ・情報解析【オプション】
    ヒトエクソーム変異解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV、short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。
    サービス内容 情報解析 検体数/データ量 参考価格 参考納期 備考
    ヒトエクソーム解析 変異解析 16検体/100 Gbase ¥175,000 +約2週間 ヒトエクソーム解析ご依頼の場合のオプション。bamファイル、vcfファイル、変異のアノテーション情報を付加したエクセルファイルを納品
    変異解析
    ★短納期
    1~2検体/5~10 Gbase ¥65,000 +5営業日 ★短納期 HiSeq相乗りプランでのヒトエクソーム解析ご依頼の場合のオプション。 bamファイル、vcfファイル、変異のアノテーション情報を付加したエクセルファイルを納品
    8検体/~40 Gbase ¥110,000
  • RNA-seq解析
    納期重視のHiSeq相乗りプラン、検体あたりのコストを抑えたNovaSeq相乗りプランを選択いただけます。
    微量サンプルの解析にはSMART-seq相乗りプランをご利用ください。NovaSeq相乗りプランは、検体数に応じた価格設定をしています。下記以外の検体数の場合はお問合せください。

    ・シーケンス解析
    シーケンサー ライブラリー データ量(目安) 送付サンプル 価格(税別) 納期
    HiSeq 2500
    (100PE)
    TruSeq Stranded mRNA
    Library Prep Kit
    4,000万リード /検体 total RNA 4μg以上
    (濃度 200ng/μL以上)
    ¥140,000 2~4週間
    ★短納期
    SMART-seq v4
    + Nextera DNA Sample Prep Kit
    4,000万リード/検体 ◎SMART-seq
    total RNA 50ng程度
    ¥180,000 4~6週間
    ★短納期
    NovaSeq 6000
    (150PE)
    TruSeq Stranded mRNA
    Library Prep Kit
    6.6億リード/8検体 total RNA 4μg以上
    (濃度 200ng/μL以上)
    ¥590,000/8検体
    *約¥74,000/検体
    約2ヶ月
    6.6億リード/16検体 ¥830,000/16検体
    *約¥52,000/検体
    ・情報解析【オプション】
    既知遺伝子発現解析:参照配列にシーケンスリードをマッピングし、既知遺伝子の発現量を算出したファイルを納品いたします。
    サービス内容 情報解析 検体数/データ量 参考価格 参考納期 備考
    RNA-seq解析 既知遺伝子
    発現解析
    16検体/6億リード ¥250,000 +約2週間 対象生物種: ヒト、マウス、ラット、イネ、シロイヌナズナ。その他の生物種はお問い合わせください。
    既知遺伝子
    発現解析
    ★短納期
    2検体/8,000万リード ¥120,000 +5営業日 ★短納期 HiSeq相乗りプランでのRNA-seq解析ご依頼の場合のオプション。
    対象生物種: ヒト、マウス、ラット、イネ、シロイヌナズナのみ
    6検体/2.4億リード ¥220,000
    * シーケンス解析ではFastqファイルを納品いたします。情報解析はオプションでお申し込みください。
    * 血液・細胞・組織などからのRNA抽出サービスのオプションもございます。
    * データ量はあくまでも目安となります。保証するものではございません。
[オプション解析]

  • 核酸抽出
    核酸抽出からご依頼の場合は、納期+2週間程度かかります。検体数、検体種類によっては納期が遅れる場合がございます。
  • 短納期情報解析
    HiSeq相乗りプランのオプションメニューです。HiSeq相乗りプランをご依頼の場合のみ、ご依頼いただけます。シーケンス納期+5営業日程度にて納品いたします。
  • WEB納品
    HiSeq相乗りプランのオプションメニューです。HiSeq相乗りプランご依頼で、情報解析のオプション無しの場合にご選択いただけます。通常価格より¥5,000お値引させていただきます。
    注意事項をご確認の上、ご選択ください。
  • 情報解析(通常納期)
    オンライン注文にて、下記メニューを選択いただくことも可能です。短納期シーケンスをご依頼の場合は、こちらの情報解析(通常納期)はご選択いただけません。

    ・既知遺伝子発現解析
    参照配列にシーケンスリードをマッピングし、既知遺伝子の発現量を算出したファイルを納品いたします。
    ・ゲノム変異解析
    参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。
    ・ヒトエクソーム変異解析
    参照配列にシーケンスリードをマッピングし、変異(SNV, short In/Del)を検出したファイルを納品いたします。
  • クラウド解析サービス
    クラウド解析サービスでは、サーバ上にアップロードした解析結果より、お客様自身で変異絞り込みや比較解析を簡単に行っていただけます。
    クラウド解析は事前のWEB会員登録が必要です。納品後6ヶ月間ご利用いただけます。

    VariantFilter
    変異解析結果より、クラウド上で変異の絞り込みを行っていただくことが可能です。目的遺伝子、既知SNP、変異クオリティ、人種別アレル頻度、疾患影響度、変異影響度などを使用した変異絞り込み、疾患群とコントロール群を指定し、疾患群特異的な変異の絞り込み等が可能です。
    Expression
    既知遺伝子発現解析結果より、クラウド上でデータフィルタリング、比較解析・統計検定、各種作図(ベン図、Scatter Plot、Heatmap等)を行っていただけます。
【HiSeq相乗りプランについて】 ・オンライン注文限定のサービスです。一度に最大10検体をご依頼いただけます。
・カレンダーをご確認の上、オンライン注文にてご依頼ください。オンライン注文はこちら
・カレンダーの◆印のサンプル到着期限日の午前中まで必着でサンプルをお送りください(サンプルの受入は平日のみです)。
・サンプル到着期限日◆より、10営業日で納品物をタカラバイオより発送します。
・オプションの短納期情報解析もあわせてご依頼の場合は、カレンダー発送予定日より+5営業日程度お時間をいただきます。
◆ … サンプル到着期限日(この日の午前中まで必着で送付してください。)
● … データ発送予定日

<HiSeq相乗りシーケンス 注意事項>
・サンプル受領後、弊社にて品質検定を実施しますが、品質結果の途中報告は行いません。
送付サンプルの品質基準に満たなくても、作業は進めさせていただきます。
・サンプル到着期限日◆の午前中までにサンプルが届かなかった場合は、次のランスケジュールでの実施となります。
(例: 3月7日着 ⇒ 3月12日到着期限日のランスケジュールで実施し、3月26日の発送となります。)
・核酸抽出からご依頼の場合は、核酸抽出作業が終了後、直近のランスケジュールにて対応します。
・サンプル到着順に作業を行います。ご依頼検体数の総数が多い時は納期が延びる場合もございます。
・シーケンス不良で再シーケンスとなった場合は、納期が延びる可能性がございます。
・各作業工程における弊社判断基準を下回る場合には、カレンダー記載の納期を達成できない、または解析中止となる可能性がございます。
・解析中止となりました場合には、それまでの作業代金を申し受けております。
・納品予定カレンダーは、その他受託状況により変更することがございます。
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納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式(fastq形式ファイル)
オプション情報解析
  • マッピング結果(bam形式ファイル)
  • 解析結果(Excel形式ファイル)
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受入サンプル

各種アプリケーションによって異なりますので、お問い合わせください。
ライブラリーでの受入も可能です。
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ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

製品カタログ・リーフレット

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参考価格・納期

サービス項目 価格 納期
相乗りシーケンス解析 上記サービス内容をご確認ください 通常:検体受領後2ヶ月
短納期:カレンダー参照
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関連サイト

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※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。