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北海道システム・サイエンス / 北海道システム・サイエンス ID: J02177

次世代シーケンス　ゲノムリシーケンス解析（ヒト以外） ID: J02177

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動植物ゲノムの網羅的変異解析。カスタムリファレンスも対応！

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サービスについて

概要

ゲノムシーケンスを行い、ゲノム上の変異候補箇所を検索します。変異株の原因遺伝子を探索することができます。

解析の流れ

  1. シーケンスデータ取得
  2. リファレンスゲノムへのマッピング
  3. SNP・InDel検索 or 構造変異検索

推奨データ取得量

シーケンス仕様 Illumina 150PE
データ量 ゲノムサイズの×30以上　＊ 詳細はQ&Aをご参照ください
例）シロイヌナズナ：ゲノムサイズ130Mb → データ量4Gb以上推奨

解析メニュー

  • マッピング・SNP候補検索
    リファレンスゲノムにリードをマッピングし、リファレンス配列とリード配列を比較してSNP候補箇所を検索します。（fig.1）

    • fig.1 納品データ例：変異検索結果（EXCEL形式）
  • マッピング・構造変異検索
    リファレンスゲノムにリードをマッピングし、ペアリードのマッピング状況にもとづき、大規模な構造変異（挿入・欠失・逆位・転座）を検索します。

サンプル必要量

ライブラリ調製方法 提供サンプル種別 総量 濃度 液量
PCR-Plus DNA 500ng 以上 10ng/uL以上 30μL以上
PCR-Free 4μg以上 50ng/μL以上 30μL以上

ご注文に関して

以下のファイルをご利用の上、お問い合わせフォーム からご送付ください。

専用注文書類
次世代シーケンス_Illumina注文書（ショットガン_DNA・RNAサンプル用） (Excel)
次世代シーケンス_Illumina注文書（ショットガン_細胞・組織サンプル用） (Excel)
次世代シーケンス_Illumina注文書（調製済みライブラリ用） (Excel)

参考価格・納期

サービス項目 価格（税抜） 納期
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  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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