受託オンライン
Commissioned Research Online

受託オンライン
株式会社薬研社

ID: J00178
ID: J00178
富士フイルム和光純薬 / 北海道システム・サイエンス

SeqNova データ解析サービス

実験系のご提案からその後の詳細なデータ解析処理までトータルサポート


カテゴリ
遺伝子工学 > バイオインフォマティクス > バイオインフォマティクス
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【ゲノムDNAシーケンス】 > de Novoシーケンス解析
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代データマイニング

サービスについて

SeqNova LS(Large memory Server)

ゲノムサイズの大きな生物種のゲノム解析、自然環境のメタゲノム解析やメタトランスクリプトーム解析などでお困りではないですか?HSSでは次世代シーケンス解析のために大容量メモリを搭載した高機能サーバーを導入し、解析をお手伝いいたします。
次世代シーケンサーは、遺伝子発現解析、SNPなどの変異解析を行う上で非常に有効な解析ツールです。
しかし、ゲノム情報のない生物種のゲノム解析を行う場合、次世代シーケンサーから出力された短いリード配列を用いてゲノム配列の再構築をする必要があります(de novoアセンブル)。
de novoアセンブルはマッピングに比べて計算量が大きく、計算時間が長い上に大量のメモリを必要とします。 それは、de novoアセンブルを行うには全てのリード同士の組み合わせを網羅的に比較する必要があるためです。そのため、アセンブルの計算量は断片数と断片長に依存して増大していくため、ゲノムサイズの大きな生物種や多種生物ゲノムが混じった環境サンプルなどでは凄まじい計算量を要することになります。
北海道システム・サイエンス社ではヒトサイズゲノム生物のde novoアセンブルを行うことが可能な国内最大級の解析サーバーをご用意して皆様のご利用をお待ちしております。

サービス内容

下記「○」を提供しております。
アプリケーション ゲノム
シーケンス
ChIP
シーケンス
mRNA
シーケンス
small RNA
シーケンス
マッピング
SNP候補検索      
変異解析      
頻度解析  
de novoアセンブル    
アノテーション付加
検体間比較
二次構造予測      
専用ビューアー向けデータ加工

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
SeqNova データ解析サービス お問い合わせ お問い合わせ

関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。