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株式会社薬研社

ID: J01382
ID: J01382
理研ジェネシス / 理研ジェネシス

Library Sequencing

様々なプラットフォームを用いた次世代シーケンス解析サービスをご提供します。


カテゴリ
シーケンス(塩基配列)解析 > 次世代シーケンス(NGS)解析【データ解析・その他】 > 次世代シーケンス解析

サービスについて

概要

NovaSeq / HiSeq / NextSeq / MiSeq(Illumina社)およびIon S5TM(ThermoFisher Scientific社)を用いて、ハイスループットなシーケンス解析を実施します。お客様自身でライブラリー調製を行っていただくことで、次世代シーケンス解析をお手頃な価格でご利用いただけます。

  • 解析フロー

    1. ライブラリーDNAの品質評価
    2. NGSを用いたシーケンシング
    3. シーケンスデータの品質評価

特長

  • 様々なプラットフォームを用いた次世代シーケンス解析サービスをご提供。
  • ライブラリーDNAからのシーケンス解析を短期間でご提供。
  • ハイスループットなシーケンス解析を1解析単位(1レーンまたは1ラン)からお手頃な価格でご提供。

解析内容

機種 シーケンシング試薬
またはチップ(*1)
リード長 ペアエンド /
シングルエンド
リード数(データ量)(*2)
HiSeq 2500 Rapid v2試薬 100bp ペアエンド 約250M(約25Gb)/レーン
HiSeq 2500 V4試薬 100bp ペアエンド 約450M(約45Gb)/レーン
NovaSeq 6000 S4試薬 150bp ペアエンド 約5B(約750Gb)/ラン
NextSeq Mid Output v2.5試薬 150bp ペアエンド 約220M(約33Gb)/ラン
NextSeq High Output v2.5試薬 150bp ペアエンド 約660M(約100Gb)/ラン
MiSeq V2試薬 150bp ペアエンド 約24M(約3.6Gb)/ラン
MiSeq V3試薬 300bp ペアエンド 約44M(約13Gb)/ラン
Ion S5TM Ion 540チップ ~200bp シングルエンド 約60M/ラン

*1 上記以外のシーケンシング試薬またはチップを使用した解析をご希望の場合は、別途ご相談ください。
*2 上記リード数およびデータ量は、目安の数値であり、それらを保証するものではありません。


納品物

  • 解析報告書
  • データHDD:シーケンスデータ(FASTQファイルなど)

サンプル条件

プラットフォーム Novaseq / HiSeq / NextSeq / MiSeq Ion S5TM
サンプルの種類 プールされたライブラリーDNA(*1) プールされたライブラリーDNA(*1)
DNA濃度(*2) 10nM以上 1nM以上
溶液量 15μL以上 20μL以上
推奨ライブラリーサイズ(*3) 300~700bp 250~350bp
溶媒 各社推奨バッファー 各社推奨バッファー

*1 1レーンまたは1チップ分を1チューブにプールしたものをご提出ください。
*2 サンプルの濃度測定は、qPCR法により、各社のプロトコールに従い実施することを推奨しております。
*3 プーリング前のライブラリDNAに関して、Agilent 2100バイオアナライザを用いた解析結果がお手元にある場合は提出をお願いいたします。


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