網羅的な転写因子やクロマチン修飾の動態解析にご利用頂けます。
機種 | NovaSeq 6000 |
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ペアリード数/サンプル | 約20M ペアリード(*1) |
リード長 | 100bp(*2) |
シーケンス方法 | Paired End / Multiplex |
バイオインフォマティクス解析 | コールされたピーク領域のリスト、ピークに近接する遺伝子のリスト、 ピーク領域に見られるモチーフ配列、GO解析データ |
納期 | 品質評価通過後、約3ヶ月(*3) |
*1 1検体当たり20M以上のリード数を推奨いたします。
*2 バイオインフォマティクス解析時にリード長を50 bpのシングルエンドにトリミングします。
*3 同時に解析を行うサンプル数が多い場合には、別途お打ち合わせの上、決定いたします。
サンプルの種類 | ChIPed DNA / コントロールDNA(*1) |
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DNA量 | 40ng |
濃度(*2) | 1ng/μL以上 |
フラグメントサイズのピーク | 700bp以下(推奨200~300bp)(*3) |
溶媒 | 1x TE |
解析対象の生物種 | ヒト、マウス |
*1 input DNAや非特異的IgG抗体で免疫沈降したDNAをコントロールとしてご提出ください。
*2 サンプルの定量はQubitまたはPicoGreenを用いた方法を推奨しております。
*3 免疫沈降前の電気泳動写真がお手元にある場合にはご提出をお願いします。
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サービス項目 | 価格(税抜) | 納期 |
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ChIP Sequencing | お問い合わせ | お問い合わせ |
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