Cell free DNA（cfDNA）を用いて、癌種ごとに絞り込まれた150以上の変異を、一度のアッセイで同時に解析可能です。
| パネル名 | 対象遺伝子（＊） | ターゲット変異情報 |
|---|---|---|
| OncomineTM Lung cfDNA Assay | ALK, BRAF, EGFR, ERBB2,KRAS, MAP2K1, MET, NRAS,PIK3CA, ROS1, TP53 | 非小細胞肺癌における150以上のSNV/Short InDelをターゲット 【主な対象SNV/Short InDel】 EGFR：T790M, C797S, L858R, Exon 19 del KRAS：G12X, G13X, Q61X BRAF：V600E ALK：Exon 21-25上のSNVまたはShort InDel PIK3CA：E545K, H1047R, E542K |
| OncomineTM Colon cfDNA Assay | AKT1, BRAF, CTNNB1, EGFR,ERBB2, FBXW7, GNAS, KRAS,MAP2K1, NRAS, PIK3CA,SMAD4, TP53, APC | 大腸癌における240以上のSNV/Short InDelをターゲット 【主な対象SNV/Short InDel】 KRAS/NRAS：G12X, G13X, Q61X BRAF：V600E PIK3CA：E545K, H1047R TP53：R175H, R273H/C/L SMAD4：R361C/H CTNNB1：S45F, T41A |
| OncomineTM Breast cfDNA Assay v2 | AKT1, CCND1（＊）, EGFR, ERBB2, ERBB3,ESR1, FBXW7, FGFR1（＊）, KRAS, PIK3CA,SF3B1, TP53 ＊ CNVのみの解析。 |
乳癌における150以上のSNV/Short InDel、TP53のコーディング領域、下記3遺伝子のCNVをターゲット。 【主な対象SNV/Short InDel】 PIK3CA：E545K, H1047R AKT1：E17K ESR1：抗エストロゲン耐性に関与する変異 TP53：機能喪失変異 ERBB2：抗HER2療法の感受性に関与する変異 【CNV対象遺伝子】 CCND1、ERBB2、FGFR1 |
| OncomineTM Pan-Cancer Cell-Free Assay | AKT1, ALK, APC, AR, ARAF, BRAF, CCND1（＊）, CCND2（＊）, CCND3（＊）, CDK4（＊）, CDK6（＊）, CHEK2, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ESR1, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FLT3, GNA11, GNAQ, GNAS, HRAS, IDH1, IDH2, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MTOR, MYC（＊）, NRAS, NTRK1, NTRK3, PDGFRA, PIK3CA, PTEN, RAF1, RET, ROS1, SF3B1, SMAD4, SMO, TP53 ＊ CNVのみの解析。 | 900以上のSNV/Short InDel、TP53のコーディング領域、下記12遺伝子のCNVをターゲット。 【主な対象SNV/Short InDel】 EGFR：T790M, C797S, L858R, Exon 19 del KRAS/NRAS：G12X, G13X, Q61X、 BRAF：V600E ALK：Exon 21-25上のSNVまたはShort InDel >PIK3CA：E545K, H1047R, E542K SMAD4：R361C/H CTNNB1：S45F, T41A AKT1：E17K ESR1：乳がんの抗エストロゲン耐性に関与する変異 TP53：機能喪失変異 ERBB2：乳がんの抗HER2療法の感受性に関与する変異 【CNV対象遺伝子】 CCND1, CCND2, CCND3, CDK4, CDK6, EGFR, ERBB2, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, MYC |
● 各パネルの対象変異情報の詳細は、別途、お問い合わせ下さい。
| パネル名 | パネルサイズ | ターゲット領域 |
|---|---|---|
| Ion AmpliSeqTM HD Panel | 12～500アンプリコン/1プール | ヒトの任意の遺伝子変異とその周辺領域 |
| 検体数 | 8 |
|---|---|
| パネル | OncomineTM Lung cfDNA Assay |
| 機種 / チップ | Ion S5TM / Ion 530TM |
| 平均リード数 / 検体（＊） | 2Mリード以上 |
| バイオインフォマティクス解析 | SNV・Short InDelの検出 各種アノテーション付加 検体間比較のためのリスト作成 |
| 納期 | 品質評価通過後、約1.5ヶ月 |
＊ 得られるリード数は検体の品質により上記値を下回る場合がございます。
| サンプルの種類 | 推奨DNA量 | メインピークサイズ | 溶媒 | 検体送付方法 |
|---|---|---|---|---|
| Cell free DNA（cfDNA） | 100ng（＊1） | 180bp付近（＊2） | Nuclease-free水 | 低吸着チューブを使用、 冷蔵又はドライアイス詰めで送付 |
＊1 上記DNA量に満たない場合は、別途ご相談下さい。
＊2 Agilent 2100バイオアナライザーまたはAgilent2200 TapeStationによる解析結果がお手元にある場合はご提出をお願いします。
●提出時にDNA濃度情報をご連絡ください（Picogreenなどの二本鎖DNA定量を用いた方法を推奨）。
●全血または血漿サンプルからのcfDNA抽出をご希望の場合は、別途、お問い合わせ下さい。
お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。
| サービス項目 | 価格（税抜） | 納期 |
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| Target cfDNA Sequencing | お問い合わせ | お問い合わせ |
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