タカラバイオ / タカラバイオ ID: J00115

miRNA-Seq解析 ID: J00115

サービスについて

特長

  • total RNAや血清・血漿検体など、様々なサンプルから網羅的なmiRNA発現解析を行います。miRNA以外のsmall RNAの発現解析も可能です。
  • 癌などの各種疾患や生命現象のバイオマーカー探索に

概要

miRNA(microRNA)は、18~26塩基からなる機能性non-coding RNAの1つで、遺伝子発現の転写後抑制機構として注目を集めています。miRNAは組織特異的または時期特異的に多数のmRNAを制御することで、細胞増殖・アポトーシス・発生と分化・代謝などに深く関与しています。また、その異常は癌などの疾患とも密接に関わっており、数々のmiRNAとそのターゲット遺伝子の同定が進められています。更に血清や血漿中のmiRNAは細胞間の情報伝達機能を持つことが示唆されており、各種疾患や生命現象のバイオマーカーとして注目されています。タカラバイオでは、次世代シーケンサーを用いたmiRNA解析の網羅的な解析サービスをご提供いたします。

サービス内容

Total RNAをご提供いただき、シーケンスライブラリーを作製し、イルミナ社シーケンサーにてシーケンスを行います。既知のmature miRNAなどのsmall RNAについて発現量を算出した結果を納品いたします。
RNA抽出からの対応、RNA-Seq解析と合わせてのご依頼なども可能です。

  • 作業の流れ(fig.1
【オプションサービス】
・RNA抽出
・データマイニング

発現解析結果(fig.2

遺伝子ごとの発現情報(Count値およびTPM値)とアノテーション情報をExcel形式で納品いたします。

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ一式
  • 解析データ一式
【クラウド納品について】
Boxによるクラウド納品を行います。共同研究者様とのデータの共有を簡単に行っていただけます。
* クラウド納品ご選択時の注意事項
  • シーケンスデータはサイズが大きいためダウンロードに時間を要する場合がございます。
    事前に回線速度を測定し、ご確認の上、ご依頼ください。
    推奨回線速度計測サイトはこちらから
  • 回線速度が110 Mbpsの場合:500 GByteのダウンロードに10時間、50 Mbpsの場合:23時間が目安です。
  • シーケンスデータサイズの目安は以下となります。
    エクソームシーケンスやRNA-Seq
    (シーケンスデータ量 5~6 Gbase/検体)
    約5 GByte/検体
    全ゲノムシーケンス
    (シーケンスデータ量 90 Gbase/検体)
    約70 GByte/検体
  • 150 GByteを超える大量のデータをダウンロードする際にはBox Drive(デスクトップ用アプリ)をインストールしてご利用ください。
  • ご依頼内容によっては対応が難しい場合がございます。その場合は、メディア納品(HDD等)への変更をご案内します。
  • 事前のテストをご希望の場合はご連絡ください。

受入サンプル

サンプル量 濃度 液量(目安) OD260/OD280 OD260/OD230
Total RNA(*1)(短鎖を含む) 600ng以上 20ng/μL以上 30μL以上 1.6以上
血清 / 血漿由来RNA 200μL以上の血清 / 血漿分のRNA(*3)
Exosome由来RNA 1mL以上の血清 / 血漿分のRNA(*3)
血清・血漿(*2) 500μL以上 - -

*1 電気泳動にてrRNAの明瞭なバンドが検出され、分解していないことをあらかじめご確認ください。
*2 送付サンプルの採取方法によっては良質なRNAが抽出できない場合がございます。ヘパリン入り採血管は使用しないでください。
*3 比較群同士では同じ量のサンプルから同じ方法で抽出することが重要です。詳細は事前にご相談ください。
・RNAサンプルはRNase free水に溶解してください。
・DNase処理を実施してください。
・上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。

【サンプル送付容器について】
・RNAサンプルは1.5mLチューブでご送付ください。0.5 mlチューブ、PCRチューブ、8連チューブでの提供はご遠慮ください。
 24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。

<推奨プレートおよびシール>
・Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates(Eppendorf社, No. EP-0030128.648)
・タイタースティックHCフィルム(WATSON社, No. 547-KTS-HC)

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

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