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株式会社薬研社

ID: J01135
ID: J01135
Integrated DNA Technologies / Integrated DNA Technologies

PrimeTime® リアルタイムPCR用プローブ合成サービス

ハイブリダイゼーション法(プローブ法、5’ Nuclease Assay法)を比較的安価に行う事が可能です。


カテゴリ
遺伝子工学 > カスタムオリゴヌクレオチド・プライマー・プローブ・遺伝子合成 > プローブ合成・修飾
遺伝子工学 > カスタムオリゴヌクレオチド・プライマー・プローブ・遺伝子合成 > カスタムオリゴ合成・PCRプライマー合成・リアルタイムPCR用プライマー合成・DNA修飾

サービスについて

概要

PrimeTime® 製品を用いることで今まで高価だったリアルタイムPCR -ハイブリダイゼーション法(プローブ法、5’ Nuclease Assay法)を比較的安価に行う事ができます。
インターカレーション法と異なり特異性が高いため、融解曲線を描いたり、PCR後のサンプルを電気泳動する必要もありません。遺伝子発現解析において、最も確実な手法です。

現在行なっている発現解析との比較検討のために、PrimeTime® 製品の初回発注お試し無償サンプル提供も可能です。

PrimeTime® では、下記情報が一つでも決まっていれば、必要なプライマー及びプローブを合成する事が出来ます。

  1. お客様の合成したい配列
  2. 発現を見たい遺伝子
  3. 発現を見たいターゲット領域の配列
  4. 確認したいSNPs (4.LNA probe

PrimeTime® 5’ Nuclease Assayの原理(fig.1

  1. プライマーとプローブは、配列依存的にDNA配列に相補結合します。
    この状態ではプローブは分解されていないため、蛍光色素とクエンチャーは接近して存在しています。
    蛍光色素から発せられる蛍光は、クエンチャーに吸収されています。
  2. ポリメラーゼがプライマーから伸長し、DNA合成が開始されます。
  3. ポリメラーゼがプローブのところに来ると、エキソヌクレアーゼ活性により、相補結合しているプローブを分解します。
  4. プローブが分解されると、蛍光色素はクエンチャーから離れます。
    クエンチャーとの距離が大きくなるため、クエンチャーによる吸光が制限され、蛍光がリアルタイムPCR装置によって検出されるようになります。

合成サービス一覧

  • PrimeTime® qPCR Assays
    フォワードプライマー(以下 Fwプライマー)、リバースプライマー(以下 Rvプライマー)、プローブの3点を1つのチューブに入れて納品します。

    納品形態:Primer2本+Probe1本を、1本のチューブに入れて納品
    精製グレード:Probe - HPLC精製、Primer - 脱塩
    納期:5~10営業日

    ◆プレデザイン
    ヒト・マウス・ラットについては、IDTでプレデザインしたアッセイを簡単に検索・ご購入いただけます。(アッセイ検索が可能です。)
    Accession NO(Refseq Database NO)や遺伝子名だけでご購入いただけます。 ご発注時には配列を開示しておりませんが、納品時には同封されるデータシートに3本のプライマー・プローブの配列情報が記載されています。

    ◆カスタム
    プローブ、プライマー2本の配列をそれぞれ入力してください。

    色素・価格表
    5’レポータ色素/発光波長(nm) 3’クエンチャー 合成スケール
    Mini(100-rxn) 標準(500-rxn) XL(2,500-rxn)
    FAM
    520
    ZEN / IBFQ ¥10,100 ¥21,000 ¥48,500
    TAMRA ¥21,000 ¥48,500
    SUN
    554
    ZEN / IBFQ ¥10,100 ¥21,000 ¥48,500
    IBFQ ¥10,100 ¥21,000 ¥48,500
    HEX
    555
    ZEN / IBFQ ¥12,650 ¥26,800 ¥57,750
    TET
    539
    ZEN / IBFQ ¥26,800 ¥57,650
    Cy5
    668
    IBRQ ¥26,800 ¥57,750
    TAO / IBRQ ¥12,650

    ・Primerの量は、Standardの場合2.5~10nmolの範囲で、XLの場合12.5~50nmoleの範囲で指定可能です。
    * 例えばddPCRでは、プライマー:プローブ=4:1をお勧めしています。なお、Miniスケールでは、Probe / Primer量は変更できません。
    ・Probeの長さは、15~35basesです。それ以外の長さは、お問合せ下さい。
    * IBFQ: Iowa Black® FQ, IBRQ: Iowa Black® RQ, BHQ1: Black Hole Quencher® 1, BHQ2: Black Hole Quencher® 2
    >> クエンチャーについて

  • PrimeTime® qPCR Probes

    納品形態:Probeのみ納品
    精製グレード:HPLC精製
    納期:5~10営業日

    *表示価格はすべて税抜価格です。
    5’レポーター色素 / 発光波長(nm) クエンチャー 最低収量保証
    15nmol 25nmol 50nmol
    FAM
    520
    ZEN / IBFQ ¥30,000 ¥42,500 ¥67,000
    *表示価格はすべて税抜価格です。
    5’レポーター色素 / 発光波長(nm) クエンチャー 合成スケール / 最低保証
    100nmol / 10nmol 250nmol / 25nmol 1μmol / 50nmol
    FAM
    520
    TAMRA ¥34,500 ¥48,500 ¥74,000
    BHQ1 ¥34,500 ¥48,500 ¥74,000
    TET
    539
    ZEN / IBFQ ¥37,000 ¥53000 ¥78,500
    BHQ1 ¥44,000 ¥62,000 ¥92,000
    YAK
    549
    ZEN / IBFQ ¥56,500 ¥83,000
    SUN
    554
    ZEN / IBFQ ¥24,500 ¥34,500 ¥52,000
    IBFQ ¥24,500 ¥34,500 ¥52,000
    HEX
    555
    ZEN / IBFQ ¥37,000 ¥53,000 ¥78,500
    BHQ1 ¥44,000 ¥62,000 ¥92,000
    *表示価格はすべて税抜価格です。
    5’レポーター色素 / 発光波長(nm) クエンチャー 最低収量保証
    2nmol 8nmol 20nmol
    FAX
    520
    TAMRA NHSエステル ¥57,000 ¥81,000
    JOE NHSエステル
    555
    ZEN / IBFQ ¥44,500 ¥66,000
    BHQ1 ¥48,000 ¥73,000
    MAX NHS
    556
    ZEN / IBFQ ¥102,500 ¥120,000 ¥97,000
    BHQ1 ¥56,500 ¥65,500 ¥97,000
    TYE563
    563
    IBRQ ¥40,000 ¥53,000 ¥84,500
    BHQ2 ¥56,500 ¥65,500 ¥97,000
    Cy3
    564
    IBRQ ¥28,500 ¥33,000 ¥60,000
    BHQ2 ¥43,500 ¥50,000 ¥76,000
    TAMRA NHSエステル
    583
    IBRQ ¥43,500 ¥65,500
    BHQ2 ¥56,500 ¥88,000
    ROX
    608
    BHQ2 ¥105,000 ¥160,000
    IBRQ ¥79,500 ¥120,000
    TEX615
    613
    IBRQ ¥40,000 ¥53,000 ¥84,500
    BHQ2 ¥56,500 ¥65,500 ¥97,000
    Texas Red-X NHSエステル
    617
    IBRQ ¥43,500 ¥65,500
    BHQ2 ¥56,500 ¥88,000
    TYE665
    665
    IBRQ ¥40,000 ¥48,500 ¥84,500
    BHQ2 ¥56,500 ¥65,500 ¥97,000
    Cy5
    668
    IBRQ ¥28,500 ¥33,000 ¥60,000
    BHQ2 ¥43,500 ¥50,000 ¥76,000
    TAO / IBRQ ¥28,500 ¥33,000 ¥60,000

    ・Probeの長さは、15~35basesです。それ以外の長さは、お問合せ下さい。
    * IBFQ: Iowa Black® FQ, IBRQ: Iowa Black® RQ, BHQ1: Black Hole Quencher® 1, BHQ2: Black Hole Quencher® 2
    >> クエンチャーについて

  • PrimeTime® qPCR primers
    インターカレーター法での検出用です。Fwプライマー、Rvプライマーのみを1つのチューブに入れて納品します。

    納品形態:Primer2本を1本のチューブに入れて納品
    精製グレード:脱塩
    納期:5~10営業日

    プローブを必要としない、インターカレーター法用のプライマーです。プレデザインされたアッセイを検索できるため、ご自身でプライマーの設計を行う必要がありません。そのため、非常に簡便に特定遺伝子に対するプライマーをご注文頂けます。(アッセイ検索はヒト・マウス・ラットに対してのみ可能です。)

    価格(税抜)Primer 納品量反応回数
    ¥10,4205nmole500回(20μL反応系)

    納品されるPrimerは、同じID番号のPrimeTime® qPCR Assayの2本のPrimerと同じ配列です。

  • Affinity Plus qPCR Probes
    Affinity Plus qPCR プローブは、FFPE組織やリキッドバイオプシーなどの、検出が難しいターゲットや、トランスクリプトバリアントなどのSNPジェノタイピングに有益です。
    Affinity Plus qPCR プローブは最大6個までの Locked Nucleic Acid (LNA)塩基を含みます。LNAはDNA塩基と比較して安定であるため、プローブにこのLNA塩基を用いると、ハイブリダイゼーション時のTm値が向上します。
    LNAを用いることで、下記が期待できます。

    ・一般的なqPCRと比較して、ミスマッチの識別能が向上します。
    ・アッセイにおけるハイブリダイゼーションの特異性を高める簡単なアプローチです。
    ・MGB修飾よりも簡単にTm値を調整できます。

    詳しくはこちらをご覧ください。

    5’レポーター色素 クエンチャー 納品量 価格(税抜) 納期
    FAX IBFQ 0.5nmol ¥11,500 約2週間
    YAK IBFQ ¥11,500
    SUN IBFQ ¥11,500
    HEX IBFQ ¥11,500
    Cy5 IBRQ ¥14,000

    * IBFQ: Iowa Black® FQ, IBRQ: Iowa Black® RQ, BHQ1: Black Hole Quencher® 1, BHQ2: Black Hole Quencher® 2
    >> クエンチャーについて




    [Affinity Plus qPCR Probes 価格]

    *表示価格はすべて税抜価格です。
    5’レポーター色素 クエンチャー 合成スケール 最低保証 価格(税抜)
    5’6-FAM 3’BHQ1 250nmol 8nmol ¥42,500
    1μmol 20 ¥61,000
    3’IBFQ 250nmol 8 ¥35,500
    1μmol 20 ¥49,500
    5’Cy3 3’BHQ2 250nmol 8 ¥47,500
    1μmol 20 ¥67,500
    3’IBRQ-Sp 250nmol 8 ¥39,500
    1μmol 20 ¥55,500
    5’SUN 3’IBFQ 250nmol 8 ¥36,500
    1μmol 20 ¥49,000
    5’Cy5TM 3’BHQ2 250nmol 8 ¥48,500
    1μmol 20 ¥69,000
    3’IBRQ-Sp 250nmol 8 ¥41,000
    1μmol 20 ¥56,500

    * IBFQ: Iowa Black® FQ, IBRQ: Iowa Black® RQ, BHQ1: Black Hole Quencher® 1, BHQ2: Black Hole Quencher® 2
    >> クエンチャーについて



  • PrimeTime® Gene Expression Master Mix
    プローブ法用のマスターミックスで、PrimeTimeはもちろん、他社様のプローブでもご使用頂けます。

    詳しくはこちらをご覧ください。
  • 特長

    • ダブルクエンチャー(fig.2
      IDTでは、よりシグナルを増幅させ、またバックグラウンドを軽減させる「ダブルクエンチャーシステム」を採用しています。
      これまでは、5’末端と3’末端に蛍光色素とクエンチャーを用いる事が一般的でしたが、ダブルクエンチャーシステムでは、5’末端から9塩基と10塩基の間にZENやTAOというクエンチャーを付加しています。
      これにより、プローブの消光作用がより大きくなるため、顕著にバックグラウンドが軽減します。また、プローブが長くなりがちなAT-rich領域へのプローブ作製も容易になりました。
      >>さらに詳しく
    • Mini合成スケール
      IDTでは、ご利用頂きやすい小さなスケールで合成を行っております。
      5’FAM / ZEN / 3’IBFQ 100回分(20μL反応系)プローブが¥7,415/税抜、アッセイは¥9,170/税抜でお求め頂け、大変安価にプローブ法で実験を行う事ができます。
    • プレデザイン
      ヒト・マウス・ラットでは、遺伝子ごとに配列をプレデザインしたアッセイを簡単に検索・ご購入いただけます。(アッセイ検索が可能です。)
      そのため、Accession NOのみで注文が可能です。
      受注時に配列開示はしておりませんが、納品時には同封されるデータシートに3本のプライマー・プローブの配列情報が記載されています。
    • 初回割引
      初めてPrimeTimeをご利用頂いた方にもれなくminiスケール分(プローブ:¥7,415/税抜、アッセイ:¥9,170/税抜)の割引を行っております。初回のご利用であれば、他の条件はございません。
      * ウェブサイトからご注文頂いた場合、ウェブサイト上では値引きは適用されておりませんが、追ってお送りする日本語の確認書にて割引後の価格をご案内させて頂きます。

      ・初回サンプルのご依頼方法
      初回サンプルをご依頼の方は、PO Num. に「"PrimeTimeSample"+"日付"」を入力して下さい。
      例えば、8/7にオーダーする場合は、「PrimeTimeSample0807」となります。

      Probeであれば¥7,415/税抜を、Assaysであれば¥9,170/税抜をお値引きさせて頂きます。
      日本独自の値引きのため、価格はWebsiteに反映されません。注文の翌営業日までにお送りする確認書もしくは、代理店様からのお見積書にて価格をご確認下さい。
      また、値引きが適用されていない場合は、ご連絡下さい。
      PO Num. の入力方法は、こちらをご参照下さい。

    PrimeTime の選択手順(fig.3


ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
PrimeTime® リアルタイムPCR用プローブ合成サービス 上記価格表にてご確認ください 上記価格表にてご確認ください

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※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
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※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。