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株式会社薬研社

ID: J01105
ID: J01105
フィルジェン / フィルジェン

OncoScanTM CNV Plus Assay / CNV Assay 受託解析サービス

FFPEに由来する微量のDNAサンプルから、染色体のコピー数解析実験を行います


カテゴリ
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > 変異解析(CGH / CNV Array解析)
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > 遺伝子発現解析・網羅遺伝子解析
遺伝子発現解析 > マイクロアレイ解析 > 組織アレイ解析

サービスについて

概要

OncoScanTM CNV Plus Assayは、固形腫瘍のホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルから全ゲノムのコピー数解析を可能にし、CNVとLOHの検出、約900個の癌遺伝子に対する高解像度な解析、癌で頻繁に検査される体細胞変異の有無判定を高い信頼性で行うことができるCNV解析用アレイです。
OncoScanTM CNV Assayは、コピー数解析に特化したアレイです。
本アレイを用いて、FFPEに由来する微量のDNAサンプルから、染色体のコピー数解析実験を行い、専用の解析ソフトウェアを用いて行ったデータ解析結果を納品いたします。
また、Affymetrix(Thermo Fisher Scientific社)から無償提供されている固形腫瘍サンプル解析用に開発されたソフトウェア「OncoScan Nexus Express for software」で納品ファイルを読み込むことにより、より分かりやすく異常領域を可視化でき、お客様自身の要件に基づいたデータ解析が可能です。

OncoScanTM CNV Plus Assay の卓越した性能

[最新のプローブ技術]fig.1
高度に分解されたFFPEサンプルに最適化されたMolecular Inversion Probe(MIP)テクノロジーを使用することで、正確なターゲットDNAが増幅され、10年以上経過したFFPEサンプルに由来するDNAから、信頼できる質の高い全ゲノムコピー数データを生成することも可能です。
[最高の解析性能]
OncoScanTM CNV Plus Assayは、FFPEサンプルにおいて、全ゲノムコピー数とコピーニュートラルLOHの検出を含む全ゲノムLOHの解析に実用的な唯一のテクノロジーです。専用解析ソフトウェアの OncoScanTM Nexus Express for software(Nexus)は、10コピー以上の高いダイナミックレンジでCNVを検出するだけでなく、LOH、サブクローン変異及び、体細胞変異の解析を1回のアッセイで行うことが可能です。

特長・利点

  • アレイ(fig.2)(fig.3
    MIPプローブは、minor allele frequency(MAF)を有するSNPを検出する様に設計されており、厳選された22万オーバーのSNPの対立遺伝子をとらえることで、コピー数の変化から生じる対立遺伝子の不均衡に対して最大の情報を得ることができます。
    また、体細胞変異パネルは、癌遺伝子において、重要視されている9つの遺伝子(BRAF、KRAS、EGFR、IDH1、IDH2、PTEN、PIK3CA、NRAS、TP53)によって74の体細胞突然変異をカバーできます。これらの9つの遺伝子は、FISHにより確認された増幅と一致することが検証済みであるため、OncoScan® FFPE Assay Kitは、FISH検査に代わって癌遺伝子異常の確認に適した解像度と特異性の高い全く新しい視点を提供します。
  • ソフトウェア(fig.4
    OncoScanTM 専用解析ソフトウェアNexusは、固形腫瘍サンプルの解析用に開発されたTuScanアルゴリズムにより、癌組織特有の10コピーを超えるCNV領域に対し、高い解像度(50~100kb)で解析することができます。また、Whole Genome Viewer機能により、視覚的に分かりやすくアレル頻度を確認できるため、低レベルモザイクの増幅および欠失の検出、LOH、片親性ダイソミー、ホモ欠失の領域を瞬時に判断可能です。
    さらに、異常領域における統計的に有意なゲノム領域の検出および9つの癌遺伝子による体細胞変異の検出、異常領域に存在する遺伝子やmiRNAの同定も可能なため、クローン進化の評価、全ゲノムコピー数、LOH、体細胞変異データを統合することで、固形腫瘍に対する理解が深まると考えられます。
  • 受託解析サービスの流れ

    実験の流れ、納品データ等の詳細につきましては、「解析内容と実験の流れ」をご覧ください。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。


参考価格・納期

サービス名 サンプル数 価格(税抜) カタログナンバー 納期
OncoScanTM CNV Plus Assay
受託解析
10~14 ¥309,000 Cat.#F-902293-(サンプル数) お問い合わせ
15~19 ¥251,000
20~23 ¥222,000
OncoScanTM CNV Assay
受託解析
10~14 ¥245,000 Cat.#F-902695-(サンプル数)
15~19 ¥201,000
20~23 ¥180,000
オプション
ゲノムDNA抽出作業(FFPE) DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。

* 上記受託解析の価格には、アレイの価格も含んでいます。
* 上記価格には、ゲノムDNAの品質チェックの費用は含まれておりません。
品質チェックをご希望の場合は「¥5,000(税抜)/サンプル」の追加料金が必要となります。
ゲノムDNA量が少ない場合は、アガロース電気泳動による品質チェックをご希望の場合でも、チェックができませんので、予めご了承ください。


関連サイト



※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的(医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など)には使用しないで下さい。
※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
※納品物によっては、その構成物(例えば、ベクター、蛍光色素など)の使用に制限がある場合があります。
※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。
 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。