機能ゲノミクス解析ソフトウェア OmicsBox

BioBam（バイオバム） / フィルジェン

ID:K04355

メーカーサイトカタログ

農学系研究に適したゲノム解析ツール

OmicsBox

バイオインフォマティクスの知識は不要
ウェット実験の研究者向けに設計されたソフトウェアです。初めてでも簡単に使用することができます。ほとんどの作業は、アイコンを選択しパラメーターを決めるだけで、簡単に配列データを生物学的解釈を持つデータにすることが可能です。
非モデル生物に対応
OmicsBoxは、リファレンスゲノムがないデータでも解析が実行可能です。植物・水産など農学系研究に応用できるツールが多数搭載されています。様々なアノテーションデータベースにより機能情報をより深めることも可能です。
多くの科学研究引用実績
実績は高いがコマンドライン型であったりOSに制限があるオープンソフトウェアを多数組み込み、マウス操作で簡単に解析できる様にしたのがOmicsBoxの特長の1つです。特にアノテーションは、BioBam独自のアルゴリズムで7000件以上の研究引用実績があります。
高価な解析PCを必要としないので初期費用を抑えることができます。
OmicsBoxの解析や計算は、統合させたウェブサイトやBioBam社のクラウドを通して行われるため、安定したインターネット接続があれば解析可能です。

機能

遺伝子機能アノテーション
　　　♦Blast解析
　　　♦InterPro Scan
　　　♦Gene Ontology Mapping・Blast2GO Annotation
　　　♦GO-SlimよるGene Ontologyの縮小、可視化
　　　♦フィッシャーの直接確率検定を使ったエンリッチメント解析
　　　♦遺伝子セットエンリッチメント解析（GSEA）
　　　♦発現比較データを使用したパスウェイ解析（アカデミックユーザー限定）
新規ゲノム配列決定
　　　♦DNA-seq De-Novo Assembly（ショートリード、ロングリード、ハイブリッドアゼンブル）
　　　♦DNA-Seqリファレンスゲノムへのマッピング
　　　♦原核生物、真核生物の遺伝子領域予測
RNA-seqデータ解析
　　　♦RNA-Seq DeNovo Assembly（ショートリード・Pacbioロングリード）
　　　♦コンティグデータの完全性評価
　　　♦CD-HIT
　　　♦コーディング領域の予測
　　　♦RNA-Seq リファレンスゲノムへのマッピング、Transcript定量
　　　♦発現解析
　　　♦タイムコースデータ解析
　　　♦定量済みシングルセルRNA-Seqのデータ解析
メタゲノム解析
　　　♦分類学的種の同定
　　　♦宿主のDNAの除去
　　　♦メタゲノムアゼンブル
　　　♦メタゲノム遺伝子予測
　　　♦メタゲノム機能アノテーション付け
　　　♦比較解析
遺伝子の変異解析
　　　♦BAMファイルを使用した変異検出
　　　♦ゲノムワイド関連解析（GWAS）

仕様

シリーズ	OmicsBox
希望小売価格（税抜）	お問い合わせ

*OmicsBoxには、1週間無料のトライアル版がございます。お問い合わせください
*OmicsBoxは、研究利用のみ使用可能です。

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※表示金額以外に運送費、荷造費、搬入・据付費、組立設置費などを別途加算させていただくことがございます。
※製品本来の使用目的に合わせてご利用ください。
※製品によっては理化学実験の専門的な知識を必要とするものがあります。